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扁平疣由低危型HPV-3、10导致，它会在皮肤表面形成突出于皮面的“小疙瘩”。寻常疣由低危型HPV-1、2、4型引起，可发生在身体任何部位，但手部多见，好发于手指和掌部，手外伤或在水中长期浸泡是常见的诱因。此外，寻常疣还有一些特殊类型，如甲周疣、甲下疣、丝状疣、指状疣。但是，扁平疣、寻常疣不是性病，引发感染的HPV亚型与尖锐湿疣并不相同，危害也不可相提并论。

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