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吴智深2005年起担任东南大学博士生导师，2006年城市工程科学国际研究中心主任； 2009年江苏省玄武岩纤维工程中心主任；2010年东南大学校长特别助理，学术特区城市工程科学技术研究院院长，土木工程学院学术委员会主任，一级学科学术带头人；2011年任玄武岩纤维生产及应用技术国家地方联合工程研究中心主任，国家预应力工程技术研究中心工程技术委员会副主任委员；2013混凝土及预应力混凝土结构教育部重点实验室主任，2018年东南大学校务委员会副主任。
12月下旬，上海市消保委对一款标有“东北农业大学”字样的网红零食展开调查，东北农业大学后续回应称，学校不开展对外生产经营工作，学校与商品包装上所标的委托制造商和受委托制造商没有开展过任何合作。这一零食“学历造假”事件经媒体曝光后引发舆论热议。消费者反映没想到打着“农科院”旗号的零食有不少竟是假货。《工人日报》称，这类“学历造假”零食未必真的像其宣传那般绿色健康，甚至有的经检测质量不达标，存在食品安全隐患。
2019年，法院认为腾讯有充足证据证明西瓜视频App有直播《王者荣耀》的行为，最终裁定相关公司自2019年1月31日停止直播《王者荣耀》游戏。根据民事裁定书，2019年1月31日，法院作出禁令，裁定与“西瓜视频”App相关联的“运城市阳光文化传媒有限公司”“今日头条有限公司”“北京字节跳动科技有限公司”3家公司立即停止“西瓜视频”App直播《王者荣耀》游戏内容。
吴智深现任国际智慧基础设施结构健康监测学会（ISHMII）会长、国际玄武岩纤维及复合材料学会（ISBFC）会长、国际建筑纤维增强复合材料(IIFC）理事（原副会长）。中国土木工程学会理事，中国化纤工业协会玄武岩纤维分会名誉会长（原会长）、中国复合材料学会土木工程复合材料分会理事长、中国硅酸盐学会玻纤分会会副会长、中国仪器仪表学会设备结构健康监测与预警分会副理事长，中国振动工程学会结构抗振控制专业委员会副理事长，中国土木工程学会混凝土及预应力混凝土分会第七届理事会副理事长等相关国内外国际学术团体会士、理事、主任委员级重要职务20余项。